متن پیام آیتالله سید علی خامنهای رهبر معظم انقلاب(مدظله العالی) بدین شرح است:
بسمالله الرحمن الرحیم
درگذشت بانوی ادیب و فاضل و پژوهشکر سرکار خانم مهدیه الهی قمشهئی فرزند محترم مرحوم عالم ، عارف ، حکیم و شاعر برجسته و مترجم قرآن مجید، مرحوم آقای حاج شیخ مهدی الهی قمشهئی رحمه الله علیهما را به خاندان مکرم و همه آشنایان با مراتب علمی و معنوی آن بانوی گرامی تسلیت عرض میکنم و علو درجات ایشان را از خداوند متعال مسئلت مینمایم.
سید علی خامنه ای
۳ مرداد ۱۳۹۵